AIIPA è articolata in 6 Associazioni di settore e 24 Gruppi merceologici nei quali organizza le 300 aziende associate che comprendono piccole e medie realtà produttive così come grandi industrie nazionali e multinazionali.
Aderiscono inoltre ad AIIPA l'Associazione nazionale Conservieri Ittici e delle Tonnare (ANCIT) e l'Istituto Italiano Alimenti Surgelati (IIAS).